益生菌的研究越來越深入使得人們對益生菌的功能性認知越來越高，促進了益生菌行業(yè)在全球的發(fā)展。國外益生菌重點企業(yè)有科漢森、IFF（丹尼斯克）等，其均有幾十年的產(chǎn)業(yè)化生產(chǎn)經(jīng)驗，設(shè)備先進，工藝流程較完善，并擁有一批性能穩(wěn)定、能夠規(guī)�；�生產(chǎn)且得到大規(guī)模應用的專利“明星”菌株，例如科漢森的BB-12、IFF（丹尼斯克）的HOWARU®系列、雀巢的副干酪乳桿菌St-11、薩科的鼠李糖乳桿菌CRL1505、長雙歧桿菌BB536等。這些“明星”菌株產(chǎn)業(yè)化應用較早，與國內(nèi)菌株相比具有先發(fā)優(yōu)勢，同時這些菌株在國內(nèi)外應用都比較多，得到消費者的認可，嚴重擠占了國內(nèi)菌株的應用空間。
   益生菌產(chǎn)業(yè)的研發(fā)成果如論文、專利都是公開化資料，國內(nèi)研發(fā)機構(gòu)也常與國外機構(gòu)進行學術(shù)交流，國內(nèi)機構(gòu)研發(fā)與國外機構(gòu)研發(fā)的差距正在縮小，部分領(lǐng)域已與國際同步，且近幾年國內(nèi)機構(gòu)研究成果正在快速增長。
    從益生菌的研發(fā)環(huán)節(jié)來看，目前，國內(nèi)益生菌及發(fā)酵劑的研發(fā)主要依賴于高校等機構(gòu)中，國內(nèi)研發(fā)機構(gòu)中，浙江大學、南昌大學的研發(fā)重點集中在菌株篩選和基因研究階段，中國農(nóng)業(yè)大學的研發(fā)重點是菌株的性能和初步的功能研究階段，江南大學的研發(fā)重點是功能驗證和產(chǎn)業(yè)化應用。而國外的重點企業(yè)和研發(fā)機構(gòu)的重點已經(jīng)進入產(chǎn)業(yè)化應用以后的功能發(fā)現(xiàn)和功能驗證階段。企業(yè)方面，國外企業(yè)自身研發(fā)實力都比較強，與機構(gòu)的合作也比較有目的性和針對性，國內(nèi)企業(yè)研發(fā)實力很弱，大部分企業(yè)沒有研發(fā)能力，研發(fā)團隊組建時間短，研發(fā)經(jīng)驗嚴重不足，基本依靠向研發(fā)機構(gòu)索取現(xiàn)成菌株為主，中外企業(yè)研發(fā)實力差距較大。機構(gòu)方面，國外研發(fā)機構(gòu)從事益生菌及發(fā)酵劑的時間較早，擁有較多的專家學者和技術(shù)人員，而國內(nèi)研發(fā)機構(gòu)起步明顯較晚，除江南大學、中國農(nóng)業(yè)大學在上世紀90年代起步外，其他院校在益生菌及發(fā)酵劑相關(guān)領(lǐng)域的研究都不足20年，研發(fā)團隊規(guī)模偏小、研發(fā)體系尚未完全建立，國內(nèi)外研發(fā)機構(gòu)研發(fā)實力依然有差距。
   從益生菌研發(fā)的合作模式來看，國外的益生菌企業(yè)與研發(fā)機構(gòu)之間的合作模式，更傾向于市場化，企業(yè)會將益生菌研發(fā)、生產(chǎn)過程中遇到的自己團隊無法解決的問題，以市場化招投標的形式進行合作。國內(nèi)益生菌市場處于起步階段，不僅企業(yè)的研發(fā)實力薄弱，企業(yè)與研發(fā)機構(gòu)之間緊密研發(fā)的模式也比較少。大量的企業(yè)與研發(fā)機構(gòu)/大學的合作只是“面子工程”，而在真正的菌株篩選、功能驗證、穩(wěn)定性安全性馴化環(huán)節(jié)的合作很少。國內(nèi)僅有江南大學與下游應用企業(yè)的合作較為緊密，且模式比較先進。國外企業(yè)研發(fā)實力更強，能夠準確、快速的提出問題與研發(fā)需求，而國內(nèi)眾多企業(yè)的研發(fā)實力較弱，無法與研發(fā)機構(gòu)協(xié)同研發(fā)，是導致國內(nèi)外企業(yè)與研發(fā)機構(gòu)之間合作模式差異的最主要原因。另外，國內(nèi)外益生菌市場的發(fā)展階段與成熟度，也導致了市場中企業(yè)的盈利能力有所差異，進而影響了企業(yè)無法長期、大量的向研發(fā)機構(gòu)進行研發(fā)投資，也是導致這種差異的原因之一。
    整體來看，雖然中國與全球市場在益生菌的研發(fā)實力上有差距，但中國在益生菌領(lǐng)域的研發(fā)已經(jīng)取得了非常大的進步，國內(nèi)重點的益生菌研發(fā)機構(gòu)已經(jīng)具備相當量的優(yōu)秀菌株儲備，為未來中國益生菌市場本土化做準備。且國內(nèi)重點研發(fā)機構(gòu)在功能驗證背書環(huán)節(jié)也做了大量工作，雖然目前國內(nèi)本土菌株的功能驗證背書數(shù)量仍比較少，但背書的增長速度非�？臁�國內(nèi)研發(fā)機構(gòu)在益生菌領(lǐng)域申請的專利、發(fā)布的論文數(shù)量也在快速增長，且在可預見的未來時間段內(nèi)將成為全球?qū)＠�與論文數(shù)量最多的國家，屆時中國的益生菌研發(fā)實力也將取得更大的突破。