cRNA探針，是以cDNA為模板，通過體外轉(zhuǎn)錄獲得cRNA制備而成的一種單鏈探針，是一種核酸探針，屬于RNA探針。
　　cRNA探針的制備過程是，從組織或細(xì)胞中提取mRNA，經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄作用獲得cDNA，對cDNA進行克隆并連接到載體上，以克隆的cDNA為模板，以含有標(biāo)記物的核苷酸為原料，進行體外轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生cRNA。在此過程中，cRNA的轉(zhuǎn)錄方向可以控制，能夠獲得帶有標(biāo)記物的與mRNA同序列的同義cRNA探針，或者與mRNA互補的反義cRNA探針。
　　cRNA探針的工作原理是，利用cRNA探針與樣品核酸分子進行雜交，若樣品中含有與cRNA探針互補的核酸序列（即目標(biāo)核酸序列），則二者相互作用通過氫鍵緊密相連形成雙鏈，洗去未雜交的多余cRNA探針，基于標(biāo)記物的自顯影或者發(fā)光作用對樣品進行檢測，獲得目標(biāo)核酸序列相關(guān)信息，即利用與cRNA探針檢測出與之互補的核酸序列。
　　cRNA探針是一種單鏈探針，不存在雙鏈探針存在的與目標(biāo)核酸序列雜交結(jié)合的有效探針數(shù)量減少，導(dǎo)致雜交效率與檢測靈敏度降低的弊端，具有雜交效率高的優(yōu)點，在分子雜交領(lǐng)域應(yīng)用廣泛，特別是在原位雜交中應(yīng)用比例較高。
　　采用cRNA探針雜交形成的雙鏈穩(wěn)定性高，不會受RNA酶影響，而cRNA探針本身對RNA酶敏感，會被破壞，因此可以利用RNA酶來清除未雜交的多余cRNA探針，以排除干擾，便于后續(xù)對樣品進行探測觀察。
　　cRNA探針可應(yīng)用范圍廣泛，包括檢測同種基因在不同條件下的表達水平、協(xié)助注釋未知基因組區(qū)域、研究基因組復(fù)制機制、檢測病毒的存在以及含量等。例如，利用地高辛標(biāo)記的cRNA探針，在胰腺切片上進行原位雜交，可用來檢測胰島素基因表達產(chǎn)物mRNA，結(jié)果可靠性高。但cRNA探針制備過程較為復(fù)雜，對實驗設(shè)備、試驗環(huán)境、實驗人員技術(shù)要求較高。
   與歐美國家相比，我國基因研究起步較晚，但發(fā)展迅速，部分技術(shù)已經(jīng)達到或接近國際先進水平。同時，為實現(xiàn)疾病早發(fā)現(xiàn)、早治療以及精準(zhǔn)治療，我國基因測序行業(yè)迅速崛起，特別是高通量測序（NGS）發(fā)展速度快，倒推基因研究技術(shù)不斷進步。在此背景下，我國市場對核酸探針需求不斷增長，cRNA探針作為核酸探針的一種，未來市場前景良好。